Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms