Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms