Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffaO54786 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffaO54786 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffaO54786 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms