Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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