Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TnxbO35452 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TnxbO35452 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TnxbO35452 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms