Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nedd9O35177 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nedd9O35177 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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