Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ArxO35085 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ArxO35085 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms