Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
U90926O08546 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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U90926O08546 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
U90926O08546 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
U90926O08546 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms