Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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