Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms