Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms