Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20834J3QM72 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20834J3QM72 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20834J3QM72 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20834J3QM72 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20834J3QM72 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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