Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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