Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp408H7BX78 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms