Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp17ldG5E8G2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms