Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC067074F6RXI4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms