Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa27F2Z403 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms