Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Urb2E9Q7L1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms