Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC005561E9Q5E2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms