Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20518E9Q548 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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