Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms