Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms