Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms