Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldlrad1D3YYZ1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldlrad1D3YYZ1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldlrad1D3YYZ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldlrad1D3YYZ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldlrad1D3YYZ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms