Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms