Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfia4B8QI36 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfia4B8QI36 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms