Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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