Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms