Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NhsB1AV60 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms