Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GabreA2AMW3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms