Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34dA2AGU5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34dA2AGU5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34dA2AGU5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34dA2AGU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34dA2AGU5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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