Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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