Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Hdac6Q9Z2V5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac6Q9Z2V5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Hdac6Q9Z2V5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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