Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms