Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3Q9Z2D8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms