Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Sh3bp5Q9Z131 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5Q9Z131 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5Q9Z131 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5Q9Z131 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms