Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms