Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms