Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms