Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Slamf1Q9QUM4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms