Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms