Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms