Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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