Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms