Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl28Q9JIL2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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