Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup50Q9JIH2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms