Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms