Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hmgn3Q9DCB1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hmgn3Q9DCB1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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