Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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