Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc46a3Q9DC26 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms